MTs Ma’arif Alfalah Ngrayun, terletak di Desa Baosanlor, Kecamatan Ngrayun, Kabupaten Ponorogo, Jawa Timur, didirikan pada tahun 2009 di bawah naungan Yayasan BPPPMNU Cabang Kabupaten Ponorogo. Madrasah ini memperoleh Surat Keputusan (SK) Pendirian pada 19 Januari 2009 dengan nomor Kw/13.4/4/PP.03.2/95/2009, dan SK Operasional pada 1 Juli 2010 dengan nomor Kd.13.02/4/PP.00.5/2351/2010.
Sebagai lembaga pendidikan yang berafiliasi dengan Kementerian Agama, MTs Ma’arif Alfalah Ngrayun berkomitmen untuk mencetak generasi muda yang berakhlak mulia dan berwawasan luas. Madrasah ini telah terakreditasi dengan peringkat B berdasarkan SK No. 164/BAP-S/M/SK/XI/2017 yang diterbitkan pada 17 November 2017 .